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英特尔(INTC.US)、联想、华大基因联手:用超算加速新冠病毒研究

今日,Intel、联想以及华大基因今天宣布,三家公司正携手加快COVID-19新型冠状病毒的基因组特性分析。  

据悉,来自Intel及联想的专业技术与生命科学专家将通力合作,为华大基因的研究人员提供全新的大数据分析技术和计算资源,进一步提升其基因测序工具的分析能力,更高效地研究新型冠状病毒的基因组特性。  

Intel和联想携手为华大基因提供的技术包括一个大型高性能计算集群,可用于处理从华大DNBSEQ-T7测序系统读取的高通量数据。  

华大基因的研究人员将能够通过全新的高性能计算和基因组分析技术,以及Intel和联想的相关资源和专业知识,进一步加速他们对新型冠状病毒的基因组特性研究。  

该技术将支持科学家研究病毒的毒性、传播模式、病原体与宿主间的相互作用,进而助力流行病学及疫苗设计研究。这些工作对于未来创建更好的诊断方法和设计有效的疫苗或其他保护性措施(例如免疫疗法)是非常必要的。  

通过这项合作,华大基因将得以继续优化其新型冠状病毒检测试剂盒并获取大量有价值的信息。这些信息将有助于确定将来开发有效疫苗或治疗方法的潜在靶标。  

通过Intel和联想的共同努力,联想的超算技术支持并优化了“基因组优化和可扩展性工具”,(简称GOAST,首个获得Intel精选解决方案验证的基因组分析工具),可为全基因组测序和全外显子测序的计算提供高达40倍的加速,助力华大基因优化计算过程,高效处理数据,更快地生成可靠的基因组分析成果,从而缩短科研和临床观察的时间。  

“目前我们对这个新型冠状病毒还有很多不了解的地方。华大基因通过分析病毒基因组数据,加速对感染者的快速识别和基因组特性的研究,而这些工作需要投入巨大的计算资源,这恰恰是我们可以发挥作用的地方。”  

Intel公司市场营销集团副总裁兼中国区总经理王锐表示,“因此,我们紧密携手,为正在防疫一线进行病毒研究的科学家提供更多的计算资源和专业支持,希望与狡猾的病毒赛跑,助力疫情防控,拯救更多生命。”  

据了解,在基因测序工作中,每毫升体液通常会包含数百万个不同的病毒体,而每个病毒体的基因组则包含大约30,000个DNA碱基或字母。  

华大基因正在对许多感染患者和疑似感染患者的微生物进行基因测序,因此这些研究工作将会生成TB级乃至PB级的海量数据。要想高效地快速处理这些重要数据,就需要采用更为先进的HPC基础架构、计算技术以及优化的基因组分析方法。




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